September 20, 2021

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Sudáfrica detecta una nueva variante de interés de Covid-19 C.1.2

Sudáfrica ha identificado una posible variante de interés (VOI) de Covid-19 que se asigna al linaje PANGO C.1.2.

Sudáfrica ha identificado una posible variante de interés (VOI) de Covid-19 que se asigna al linaje PANGO C.1.2.

C.1.2 se identificó por primera vez en mayo de 2021 durante la tercera ola de Covid en el país, dijeron investigadores del Instituto Nacional de Enfermedades Transmisibles (NICD) del país y la Plataforma de Secuenciación e Innovación en Investigación de KwaZulu-Natal.

Desde entonces, se ha detectado en la mayoría de las provincias de Sudáfrica y en otros siete países que abarcan África, Europa, Asia y Oceanía, informaron los investigadores en el estudio que aún no ha sido revisado por pares y está publicado en el servidor de preimpresión. medRxiv.

La variante ha evolucionado de C.1, uno de los linajes que dominó la primera ola de infecciones por SARS-CoV-2 en Sudáfrica y se detectó por última vez en enero de 2021.

C.1.2 está “asociado con una mayor transmisibilidad y una menor sensibilidad de neutralización”, escribió el equipo, incluida Cathrine Scheepers, del NICD, en resumen.

En comparación con C.1, la nueva variante ha “mutado sustancialmente” y está más lejos del virus original detectado en Wuhan que cualquier otra variante preocupante (VOC) o VOI detectada hasta ahora en todo el mundo.

Según el estudio, C.1.2 tiene 41,8 mutaciones por año. Es aproximadamente 1,7 veces más rápido que la tasa global actual y 1,8 veces más rápido que la estimación inicial de la evolución del SARS-CoV-2.

Un período corto similar de mayor evolución también se asoció con la aparición de los COV Alfa, Beta y Gamma, dijeron los investigadores, lo que sugiere que un solo evento, seguido de la amplificación de los casos, impulsó una tasa de mutación más rápida.

Aproximadamente el 52 por ciento de las mutaciones de pico identificadas en C.1.2 se han identificado previamente en otros VOI y VOC. Estos incluyen D614G, común a todas las variantes, y E484K y N501Y que se comparten con Beta y Gamma, con E484K también visto en Eta y N501Y en Alpha.

Además, el estudio también encontró aumentos constantes en el número de genomas C.1.2 en Sudáfrica mensualmente, pasando del 0,2% en mayo al 1,6% en junio y al 2,0% en julio. Los investigadores afirmaron que es similar a los aumentos observados en Beta y Delta en Sudáfrica durante la detección temprana.

Al 20 de agosto de 2021, se incluyeron 80 secuencias que coinciden con el linaje C.1.2 en la base de datos de acceso abierto GISAID (Iniciativa global para compartir datos sobre la influenza aviar).

Se necesitan más estudios “para determinar el impacto funcional de estas mutaciones, que probablemente incluyen el escape de anticuerpos neutralizantes, y para investigar si confiere ventaja sobre la variante Delta”, dijo Scheepers.

Mientras tanto, India también ha informado de la presencia de un nuevo sublinaje AY.12 de la variante Delta de Covid, que recientemente se clasificó en Israel.

Un informe reciente del Consorcio de Genómica del SARS-CoV-2 de la India (INSACOG), muchos casos en la India que antes se clasificaron como Delta, ahora se reclasifican como AY.12.

Fuente Business-standard

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